Syn Sinéad O‘Connorovej Shane O‘Connor tragicky zomrel v januári 2022, čo zanechalo hlboký vplyv na jeho smútiacu matku. Sinéad na Twitteri oznámila, že Shane zomrel samovraždou niekoľko dní po tom, čo sa stratil. Mal 17 rokov.
V roku 1987 mala svojho prvorodeného, 36-ročného Jakea Reynoldsa, s bývalým mužom Johnom Reynoldsom.
V roku 1996 sa jej narodila dcéra Roisin Waters (27) a v roku 2004 syn Shane Lunny (†17).
Najmladšieho Yeshuu Bonadia (16) privítala v roku 2006.